Nel pomeriggio del 15 agosto 2002 è stato presentato in piazza Umberto I dal sindaco Maurizio Iorio, il nuovo gonfalone di Villa Santo Stefano. Il vessillo simbolo del paese, viene portato nelle manifestazioni più importanti.

La Giunta Comunale incaricò lo Studio Araldico di Genova per una ricerca dello Stemma Comunale: dopo ricerche, effettuate presso il Ministero per i Beni e le attività Culturali Archivio di Stato di Roma, non trovò traccia di uno stemma.

Il Comune dal 1650 circa fino all’inizio del XIX secolo ha usato come sigillo l’immagine di Santo Stefano Protomartire, coprotrettore del paese, in cotta sacerdotale che tiene nella mano destra la palma del martire, simbolo di gloria eterna riservata a coloro che sono morti per la fede.

E’ stata usata questa icona per la realizzazione del nuovo vessilo; realizzato da una ditta ciociara specializzata nel settore.